亚急性甲状腺炎，又称亚急性肉芽肿性甲状腺炎，病毒性甲状腺炎。治疗包括两方面，减轻局部症状，和针对甲状腺功能异常影响。一般来说大多数病人，仅对症状处理即可，对轻型病例采用阿司匹林，或其他止痛药，如用对乙酰胺基酚，或用水杨酸盐可控制症状。病情严重病例，如疼痛、发热明显者，可短期用其他非类固醇抗炎药，或应用糖皮质类固醇激素。如泼尼松，可迅速缓解临床表现，持续用药1到2周，甚至4到8周以后，减少药量，共用6到8周。
亚甲炎属于自愈性疾病，患者可能会出现甲亢症状，但多数是一过性的，所以不需要抗甲状腺药物治疗本病。甲减期也常是暂时的，通常甲减症状不多，所以不需要甲状腺激素替代治疗，但如果甲减情况严重者，可用甲状腺激素替代一段时间。约有10%的患者，可发生永久性甲状腺功能减退，需要长期甲状腺激素替代治疗。
