甲状腺的检查包括形态学检查，功能学检查和病因检查。因为甲状腺疾病种类很多，不同情况需要检查的内容不一样。比如说有甲功三项、甲功五项，甲状腺自身免疫抗体，还有就是碘131吸碘率的检查。甲状腺超声检查，是甲状腺最常用的影像学检查，超声可以判断患者甲状腺的大小、有没有结节、结节的性质、囊性还是实性、周围淋巴结的情况。
如果检查有甲状腺结节的话，那可以进一步的检查，怀疑有恶性可能的，可以进行穿刺活检，通过病理检查，来确定性质。因为甲状腺功能改变，会影响血糖、血脂的代谢情况，有些也会影响肝功能和血细胞等，所以经常要做大生化检查。
